Au XVIe siècle, tout un courant de pensée se développe sur la base du protestantisme (mais la dépassant largement) développant une conception politique qui sera, par la suite, qualifiée de monarchomaque, c'est-à-dire d'opposant à la monarchie.

Cette irruption d'une démarche politique était inévitable, pour deux raisons. Tout d'abord, il y avait l'affrontement entre le pouvoir royal et l'aristocratie, avec en arrière-plan la tendance à la formation de la monarchie absolue, pour centraliser et moderniser le pays.

Ensuite, il y a la situation particulière des protestants, minoritaires en France et confrontés à un catholicisme ultra tentant de maintenir un contrôle complet sur l'administration royale et sa gestion du pays.

Le problème est que ce cas de figure n'a jamais été théorisé de leur part : en Bohême, les guerres hussitesavaient montré que la naissance de deux camps était inévitable, qu'il fallait donc tenter de triompher militairement. L'Allemagne formait dans ce cadre un bon exemple, avec Martin Luther, puisque un chemin a été trouvé, même au prix de la liquidation d'une certaine radicalité religieuse.

En France, la victoire militaire était toutefois impossible, les protestants ne représentant qu'environ 10% de la population. Jean Calvin, le grand dirigeant du protestantisme français, décida alors de temporiser. Il fallait accepter l'hégémonie catholique, en attendant que la situation se débloque...